一株新正黏病毒(龍川病毒)的鑒定及分子特征研究
關(guān)鍵詞：龍川病毒 致倦庫蚊 正黏病毒 分子特征
摘要：2013年在中國廣東省開展了蟲媒病毒分布及其分子特征的研究,在廣東省龍川縣采集的致倦庫蚊中分離到一株病毒,該病毒可以引起C6/36細(xì)胞的病理性效應(yīng)。為了對該病毒進(jìn)行鑒定,并對其分子特征進(jìn)行研究,將病毒培養(yǎng)物用氯化銫進(jìn)行梯度離心,負(fù)染電鏡觀察病毒的形態(tài),提取并單引物等溫?cái)U(kuò)增(SPIA)病毒RNA,利用Ion Torrent平臺進(jìn)行深度測序,獲得的序列用CLC Genomic Wokbench 9.0軟件進(jìn)行拼接,本地BLAST進(jìn)行分類比對。用MEGA軟件登錄GenBank,下載正黏病毒科代表株序列并繪制進(jìn)化樹,同時用ClustalW2軟件與新毒株進(jìn)行氨基酸同源性比對和編碼框序列的分析。電鏡觀察結(jié)果顯示該病毒呈球形,直徑大小約100nm;深度測序共獲得6個完整開放閱讀框(Open reading fragment,ORF)的節(jié)段序列,5個節(jié)段(PB1、PB2、PA、NA、HA)的氨基酸序列與正黏病毒科的Quaranjavirus屬病毒同源關(guān)系在26.38%~67.23%之間,其中PB1的同源性最高,PB2的同源性最低,未發(fā)現(xiàn)與其它病毒有同源關(guān)系。本研究在中國首次從蚊蟲中分離并鑒定了一株新的蟲媒病毒,屬于正黏病毒科Quaranjavirus屬的家族成員,命名為龍川病毒,這是中國國內(nèi)首次報道從致倦庫蚊中分離到龍川病毒。
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