茶樹果膠乙酰酯酶家族成員的鑒定和生物信息學(xué)分析
關(guān)鍵詞：茶樹 果膠乙酰酯酶 鑒定 生物信息學(xué)分析
摘要：茶樹是氟的超富集植物,葉片高氟含量與人體健康密切相關(guān)。果膠乙酰酯酶(PAE)可能通過調(diào)控果膠的去乙?；饔脜⑴c茶樹葉片對(duì)氟的富集和解毒,然而目前并無茶樹PAEs的相關(guān)報(bào)道。本研究以茶樹舒茶早基因組和三代測序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),利用生物信息學(xué)的方法開展了PAEs的鑒定及其特性、進(jìn)化和定位分析。結(jié)果表明,在茶樹中,PAE家族有12個(gè)蛋白,屬于PAE5、PAE8、PAE9、PAE10、PAE12等5個(gè)成員,具有CLDG、PxYH、GGGWC、GS、NWN、rYCDG、GCSAG、NaAYDSWQ、HCQ等9個(gè)保守基序;在進(jìn)化關(guān)系上,茶樹PAEs與葡萄、可可親緣關(guān)系較近;12個(gè)CsPAEs氨基酸大小為326~515,分子量為36.7~56.9 kDa,等電點(diǎn)為5.1~8.9;除CsPAE5、CsPAE5-1定位線粒體,CsPAE10-1可能定位胞質(zhì)外,其他9個(gè)CsPAEs定位細(xì)胞壁;CsPAE5、CsPAE5-1、CsPAE12和CsPAE12-1為跨膜蛋白。此研究結(jié)果將為解析PAE在茶樹葉片氟富集和解毒過程中的功能奠定基礎(chǔ)。
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