大豆籽粒不同發(fā)育時(shí)期的轉(zhuǎn)錄組分析
關(guān)鍵詞：大豆 差異表達(dá)基因 油脂合成 轉(zhuǎn)錄組測序
摘要：為了從分子水平上研究大豆籽粒不同發(fā)育時(shí)期的油脂合成與累積機(jī)理,對大豆開花20 d(DD20)、30 d(DD30)、40 d(DD40)、50 d(DD50)的籽粒進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序。通過對轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的分析,共得到原始數(shù)據(jù)461 566 988條,經(jīng)過濾獲得開花后20,30,40和50 d的clean reads,分別為107 548 920,111 670 776,109 339 672和108 884 270條。DD20/DD30、DD30/DD40、DD40/DD50比較組中的差異表達(dá)基因分別為4 759,6 245和13 763個(gè),其中上調(diào)基因分別為1 801,2 941和5 695個(gè)。差異表達(dá)基因的KEGG pathway分析中,分別得到134,133和136條代謝通路,篩選到8個(gè)與油脂合成相關(guān)的差異表達(dá)基因,ACC、FATB、GPAT、DGAT1、G3PDH、KASI、SAD和FAD2。研究結(jié)果對深入研究大豆籽粒脂質(zhì)合成的調(diào)控機(jī)理及大豆高油育種具有重要參考價(jià)值。
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