關(guān)鍵詞:微衛(wèi)星標(biāo)記 跨物種擴(kuò)增
摘要:【目的】篩選高多態(tài)性竹?魚(yú)(Trachurus japonicus)微衛(wèi)星(SSR)標(biāo)記,并驗(yàn)證其在鲹科魚(yú)類(lèi)中的通用性?!痉椒ā坎捎肧LAF-seq技術(shù)識(shí)別竹?魚(yú)基因組SSR標(biāo)記,利用聚丙烯酰胺凝膠電泳和毛細(xì)管電泳篩選高多態(tài)性位點(diǎn),并進(jìn)行跨物種PCR擴(kuò)增?!窘Y(jié)果與結(jié)論】識(shí)別出43264個(gè)二至六堿基重復(fù)SSR標(biāo)記,二、三堿基重復(fù)SSR標(biāo)記較多(90.33%)。篩選出37個(gè)多態(tài)性的二、三堿基SSR位點(diǎn),各位點(diǎn)的等位基因數(shù)為4~26,期望雜合度為0.481~0.935,多態(tài)信息含量為0.440~0.934。有30個(gè)位點(diǎn)符合哈迪-溫伯格平衡,且各位點(diǎn)間不存在連鎖不平衡現(xiàn)象。共有28個(gè)竹.魚(yú)SSR標(biāo)記可在1種以上鲹科魚(yú)類(lèi)中有效擴(kuò)增,分別有24、21、20、19和11個(gè)SSR位點(diǎn)可在藍(lán)圓鲹(Decapterus maruadsi)、長(zhǎng)身圓鲹(Decapterus macrosoma)、無(wú)斑圓鲹(Decapterus kurroides)、頜圓鲹(Decapterus macarellus)及金帶細(xì)鲹(Selaroides leptolepis)中穩(wěn)定擴(kuò)增,可為竹?魚(yú)遺傳資源評(píng)估和部分鲹科魚(yú)類(lèi)的系統(tǒng)進(jìn)化分析提供重要遺傳物質(zhì)基礎(chǔ)及有力的分析手段。
廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào)雜志要求:
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