可變剪接在肺腺癌預(yù)后中的價值
關(guān)鍵詞：肺腫瘤 預(yù)后 肺腺癌 可變剪接 臨床結(jié)果
摘要：目的:探討可變剪接在肺腺癌預(yù)后中的作用。方法:在TCGA數(shù)據(jù)庫中收集474例肺腺癌組織的RNA-seq數(shù)據(jù),繪制可變剪接圖譜;通過單因素Cox回歸分析確定肺腺癌中存活相關(guān)的剪接事件,再利用最小絕對收縮模型篩選用于監(jiān)測存活的預(yù)后因子;收集5例肺腺癌患者的癌組織,采用PCR擴增及瓊脂糖凝膠電泳檢測CHEK 1、KIF 23、MCM 7和FN 1的mRNA亞型條帶。結(jié)果:在肺腺癌中存在著大量的可變剪接事件并與預(yù)后相關(guān),包括CHEK 1、KIF 23、MCM 7和FN 1,通過生物信息學利用可變剪接事件構(gòu)建了高效的風險預(yù)測模型;KEGG途徑分析表明,主要富集的基因與““regulation of autophagy”、“central carbon metabolism in cancer”和“cell cycle”有關(guān);5例肺腺癌患者的癌組織PCR擴增結(jié)果顯示,可變剪接核心基因CHEK1、KIF23、FN1確實存在CHEK1-AP-19309、KIF23-AP-31390、FN1-ES-57398等剪接體。結(jié)論:可變剪接事件可作為預(yù)測肺腺癌患者臨床結(jié)果的指標,可為肺腺癌患者制定個體化治療方案提供依據(jù)。
貴州醫(yī)科大學學報雜志要求:
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