水稻OsHDT703基因的可變剪接體分析
關鍵詞：水稻 hd2蛋白家族 可變剪接 生物信息學
摘要：為了克隆水稻HD2蛋白基因OsHDT703,并分析其存在的可變剪接體。利用生物信息學分析,結合RT-PCR、TA克隆和測序等方法,鑒定1個水稻中全新的HD2蛋白成員(OsHDT703)。結構域分析發(fā)現(xiàn),在其N端含有HD2家族的NPL保守結構域。選取來源于7個物種的16個HD2蛋白,構建蛋白進化樹,結果發(fā)現(xiàn),OsHDT703蛋白與OsHDT702蛋白處于同一分支;OsHDT701則處于另一分支,說明水稻中HD2家族蛋白可能存在功能分化。根據(jù)預測的不同剪接體設計4對特異性引物,以粳稻中花11葉片和幼穗cDNA為模板,利用RT-PCR擴增,結合TA克隆,通過測序比對,成功鑒定到4種不同可變剪接體序列。由于3號(OsHDT703.3)和4號(OsHDT703.4)剪接體的CDS序列完全相同,所以證明OsHDT703至少存在4種不同可變剪接體。綜上所述,鑒定到水稻中1個全新的HD2蛋白,命名為OsHDT703,并且鑒定出至少4種存在可變剪接體,為后續(xù)深入研究該基因生物學功能奠定基礎。
華北農(nóng)學報雜志要求:
{1}文獻條目按作者姓氏（中文姓氏按其漢語拼音）的字母順序、中外文分別排列。
{2}來稿應具有學術性與理論性，并且在選題、文獻、理論、方法或觀點上有創(chuàng)新性。
{3}本刊反對剽竊、抄襲、一稿兩投或多投，請確定來稿為未征其他公開出版物和學術網(wǎng)站上發(fā)表的原創(chuàng)論文。
{4}題名：文題應相符，鮮明簡潔，最多不超過20個漢字。
{5}作者和通訊作者的姓名、工作單位科室、電話、詳細通訊地址、郵編和Email。
注：因版權方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
