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玉米大斑病菌轉(zhuǎn)錄因子StMSN4基因的克隆及表達(dá)模式分析

李學(xué)然; 畢歡歡; 薛江芝; 李路陽(yáng); 王欣宇; 劉玉衛(wèi); 谷守芹; 韓建民 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/河北省植物生理與分子病理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 河北保定071000

關(guān)鍵詞:玉米大斑病菌 msn4 基因結(jié)構(gòu) 

摘要:為明確玉米大斑病菌轉(zhuǎn)錄因子StMSN4基因的結(jié)構(gòu)特征及其在病菌重要生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期的表達(dá)模式,本試驗(yàn)以釀酒酵母ScMSN4氨基酸序列為探針,在玉米大斑病菌基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索并克隆其同源基因,并對(duì)該基因的結(jié)構(gòu)及其編碼蛋白的理化性質(zhì)、空間結(jié)構(gòu)等進(jìn)行預(yù)測(cè);通過(guò)分析病菌關(guān)鍵生長(zhǎng)發(fā)育階段的RNA-Seq數(shù)據(jù),明確該基因的表達(dá)模式。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在玉米大斑病菌基因組中搜索并克隆得到了ScMSN4的同源基因,將其命名為StMSN4;該基因DNA全長(zhǎng)為1357 bp,cDNA全長(zhǎng)為1296 bp,包含2個(gè)外顯子,1個(gè)內(nèi)含子;其編碼蛋白包含431個(gè)氨基酸,含有2個(gè)典型ZnF-C2H2保守結(jié)構(gòu)域。通過(guò)對(duì)病菌的菌絲、分生孢子、芽管、附著胞和侵入釘時(shí)等5個(gè)典型發(fā)育時(shí)期的RNA-Seq數(shù)據(jù)分析表明,StMSN4基因在5個(gè)發(fā)育時(shí)期均有表達(dá),且表達(dá)水平較高,表明該基因在病菌的生長(zhǎng)發(fā)育階段發(fā)揮著重要的作用。本研究不僅明確了StMSN4基因的結(jié)構(gòu)特性及其表達(dá)模式,也為深入研究該基因的功能及HOG-MAPK信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的作用機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。

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