小麥幾丁質(zhì)酶基因家族的全基因組鑒定及禾谷鐮刀菌脅迫下的表達(dá)分析
關(guān)鍵詞：小麥 幾丁質(zhì)酶基因家族 全基因組鑒定 禾谷鐮刀菌 表達(dá)模式
摘要：對(duì)小麥幾丁質(zhì)酶基因家族成員進(jìn)行鑒定,并對(duì)其基因結(jié)構(gòu)、保守基序、染色體分布、系統(tǒng)進(jìn)化及禾谷鐮刀菌脅迫下的表達(dá)水平進(jìn)行分析,為進(jìn)一步研究幾丁質(zhì)酶基因在小麥應(yīng)答各種生物脅迫中的作用和在抗病分子育種中的應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。結(jié)果表明,從小麥基因組中共鑒定到159個(gè)幾丁質(zhì)酶基因,分布在21條染色體上;小麥幾丁質(zhì)酶基因家族成員分為5類(lèi),隸屬于GH-18和GH-19兩個(gè)亞家族。GH-18亞家族包括Ⅲ、Ⅴ類(lèi),分別含有34、48個(gè)基因;GH-19亞家族包括Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ類(lèi),分別包含52、13、12個(gè)基因。同一亞家族的成員聚類(lèi)在同一分支上,并且具有相似的外顯子-內(nèi)含子基因結(jié)構(gòu)和保守基序。在被禾谷鐮刀菌侵染后,4個(gè)小麥品系中幾丁質(zhì)酶基因家族一些成員的表達(dá)均顯著上調(diào)。
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