2014年龍巖市手足口病患者CVA10病毒基因特征分析
關(guān)鍵詞：手足口病 柯薩奇病毒a10 vp1區(qū)
摘要：目的了解2014年龍巖市手足口病病例中分離到的CVA10病毒VP1區(qū)基因特征。方法 2014年共收集221份采用實(shí)時(shí)熒光RT-PCR法判定為其他EV的HFMD患者樣本,經(jīng)RD細(xì)胞分離培養(yǎng)后,再次進(jìn)行特異性核酸檢測(cè)。通過(guò)引物486-489進(jìn)行腸道病毒A組完整的VP1序列分段擴(kuò)增,采用ClustalX2、Mega6.0進(jìn)行核苷酸及氨基酸序列同源性分析和構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果通過(guò)測(cè)序獲得3株CVA10完整的VP1區(qū)基因序列,通過(guò)分析計(jì)算,LY2014116與LY2014163氨基酸相似性為100%,3株分離株與原型株Kowalik(AF081300)的核苷酸(nt)同源性均為76%,氨基酸(aa)同源性為89%-90%。結(jié)論 3株分離株均位于進(jìn)化樹(shù)D亞型的同一分支上,與國(guó)內(nèi)其他地方分離的D亞型流行株親緣關(guān)系較近,與俄羅斯、法國(guó)等地分離的病毒差異較大。
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