關(guān)鍵詞:牦牛 eppin基因 生物信息學(xué) 附睪 組織表達(dá)
摘要:為了研究牦牛附睪組織中精子成熟的相關(guān)機(jī)理,并為探討高原動物的生殖機(jī)制提供基本數(shù)據(jù)。本研究運(yùn)用基因克隆技術(shù)對牦牛附睪Eppin基因CDS全長序列進(jìn)行克隆,采用生物信息學(xué)方法進(jìn)行分析,Eppin基因和編碼序列特征進(jìn)行了預(yù)測和分析。結(jié)果表明,牦牛Eppin基因的CDS含有一個405 bp長度的片段,由134個氨基酸編碼;牦牛Eppin基因?qū)?yīng)的蛋白分子量和理論等電點(diǎn)分別為15.09 ku和8.67 ku,其對應(yīng)的氨基酸沒有跨膜結(jié)構(gòu),歸于近水性蛋白;25個α-螺旋、27個延伸鏈、2個β-折疊及80個無規(guī)則卷曲構(gòu)成其蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu);牦牛Eppin基因編碼氨基酸序列與黃牛、藏羚羊、綿羊等物種間同源性較高,系統(tǒng)進(jìn)化情況與其親緣關(guān)系遠(yuǎn)近一致。本研究應(yīng)用實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)分析Eppin基因在附睪組織3個不同區(qū)段(頭部,頸部和尾部)中的表達(dá)情況,熒光定量PCR結(jié)果顯示,Eppin基因在牦牛附睪組織3個不同區(qū)段中均有不同程度的表達(dá),在附睪頭部中表達(dá)最高,頸部和尾部表達(dá)較低。本研究將為牦牛附睪精子成熟的機(jī)制和Eppin基因在牦牛附睪上皮細(xì)胞中的功能提供一定的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
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