龍眼體胚發(fā)生過程中RNA甲基化相關(guān)基因全基因組鑒定及表達(dá)分析
關(guān)鍵詞：龍眼 rna 甲基化相關(guān)基因 龍眼體胚發(fā)生早期 生物信息學(xué)分析
摘要：為了解龍眼RNA甲基化相關(guān)基因的生物學(xué)功能,本研究基于基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用生物信息學(xué)分析方法,進(jìn)行龍眼基因組RNA甲基化相關(guān)基因成員鑒定,蛋白結(jié)構(gòu)域及特性分析,分子進(jìn)化樹分析,體胚發(fā)生過程和組織器官基因表達(dá)水平分析以及ABA處理下的定量表達(dá)分析。結(jié)果顯示:龍眼中有7個(gè)參與RNA甲基化過程中的關(guān)鍵基因,包括5個(gè)RNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因和2個(gè)去RNA甲基化酶基因;各成員內(nèi)含子數(shù)量差別較大,為4~28個(gè)不等;進(jìn)化樹分析顯示,龍眼RNA甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶蛋白與甜橙親緣關(guān)系最近;蛋白結(jié)構(gòu)域分析顯示,RNA甲基化相關(guān)酶具有保守的蛋白結(jié)構(gòu)域;龍眼RNA甲基化相關(guān)基因啟動(dòng)子區(qū)域中主要含有光響應(yīng)功能元件、激素響應(yīng)功能元件、脅迫響應(yīng)功能元件和分生組織表達(dá)響應(yīng)元件,推測(cè)RNA甲基化相關(guān)基因可能對(duì)植物的生長(zhǎng)發(fā)育和適應(yīng)不良環(huán)境有一定調(diào)節(jié)作用;RNA甲基化相關(guān)基因部分成員在龍眼體胚不同發(fā)生階段和不同組織器官中的表達(dá)有明顯區(qū)別,推測(cè)龍眼RNA甲基化相關(guān)基因可能參與不同體胚發(fā)育階段和組織器官形態(tài)建成;不同濃度ABA處理下,龍眼EC中RNA甲基化相關(guān)基因的表達(dá)情況各異,其中DlVIR、DlALKBH10B和DlMTB的相對(duì)表達(dá)量受到一定的抑制作用,而DlFIP37則呈現(xiàn)上調(diào)表達(dá),暗示龍眼RNA甲基化相關(guān)基因參與激素響應(yīng)途徑。本研究表明,龍眼RNA甲基化相關(guān)基因除了可能在葉的形成、花的發(fā)育和植株的形態(tài)建成等方面發(fā)揮重要的作用外,還可能參與調(diào)控胚胎發(fā)育和響應(yīng)非生物脅迫,推測(cè)龍眼RNA甲基化相關(guān)基因成員在功能上具有差異性和多樣性。
熱帶作物學(xué)報(bào)雜志要求:
{1}基金項(xiàng)目論文：論文所涉及的課題如為國(guó)家或部、省級(jí)基金或?qū)俟リP(guān)項(xiàng)目，應(yīng)腳注于文題頁左下方，并附基金證書復(fù)印件。
{2}如該稿曾在學(xué)術(shù)交流會(huì)議上宣讀或在內(nèi)部刊物上刊出，請(qǐng)?jiān)谕陡鍟r(shí)注明。
{3}文章數(shù)量關(guān)系盡量用圖表列出，圖表不超過6幅，盡可能緊隨文字之后，圖中所標(biāo)字母和符號(hào)必須清晰醒目，大小適中。
{4}注釋用于對(duì)文章正文作補(bǔ)充論說的文字，采用頁下注，注號(hào)用①②③；參考文獻(xiàn)用于說明引文出處，采用文末注，用［1］［2］［3］順序標(biāo)注。
{5}正文一級(jí)標(biāo)題采用漢字?jǐn)?shù)字“一、二、三……”形式排序；正文二級(jí)標(biāo)題采用漢字?jǐn)?shù)字加括號(hào)“（一）、（二）、（三）……”形式排序，正文三級(jí)標(biāo)題采用阿拉伯?dāng)?shù)字“1、2、3……”形式排序，正文四級(jí)標(biāo)題采用阿拉伯?dāng)?shù)字“①、②、③……”形式排序。
注：因版權(quán)方要求，不能公開全文，如需全文，請(qǐng)咨詢雜志社
