龍眼HD-Zip基因家族生物信息及表達(dá)分析
關(guān)鍵詞：龍眼 基因 體胚 表達(dá)模式
摘要：為了解龍眼HD-Zip基因家族的功能,本研究基于龍眼基因組與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)提取的19個(gè)龍眼HD-Zip家族成員的啟動(dòng)子、可變剪接以及受到調(diào)控的miRNA種類進(jìn)行分析;并采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),分析了在ABA處理下龍眼胚性愈傷組織(embryonic callus,EC)中HD-Zip部分成員的表達(dá)模式,以及HD-Zip部分成員在不同體胚階段的表達(dá)模式。結(jié)果表明:龍眼HD-Zip家族除含有TATA-box和CAAT-box以外還含有大量的光響應(yīng)元件、激素響應(yīng)元件以及脅迫響應(yīng)元件,暗示龍眼HD-Zip家族成員可能參與光反應(yīng)、激素響應(yīng)以及非生物脅迫的過(guò)程;龍眼HD-Zip在不同組織部位與不同體胚階段的可變剪接方式主要以內(nèi)含子保留為主;龍眼HD-Zip基因家族成員主要受到miRNA166a的調(diào)控;在外源激素ABA處理下龍眼EC中HD-Zip家族部分成員的表達(dá)模式以及部分成員在不同體胚階段的表達(dá)模式都呈現(xiàn)多樣化,推測(cè)龍眼HD-Zip參與龍眼不同體胚發(fā)育的調(diào)控,并且可能通過(guò)調(diào)節(jié)內(nèi)源ABA的濃度進(jìn)而影響胚性愈傷組織的生長(zhǎng)發(fā)育以及形態(tài)的建成。
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