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哺乳動(dòng)物細(xì)胞色素P450酶中底物識(shí)別位點(diǎn)與功能的進(jìn)化關(guān)系

王珺霞 畢杰 盧星宇 王振 李亦學(xué) 上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院 上海200240 上??萍即髮W(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院 上海200031 中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 上海200031 上海生物信息技術(shù)研究中心 上海201203

關(guān)鍵詞:cyp酶 家族規(guī)模 活躍亞家族 底物識(shí)別位點(diǎn) 進(jìn)化速率 

摘要:細(xì)胞色素P450(cytochromeP450,CYP)酶存在于所有哺乳動(dòng)物中,它們從共同的祖先通過基因倍增進(jìn)化而來,以一種“爆炸性”的趨勢(shì)形成了龐大的超家族。除代謝脂質(zhì)等內(nèi)源性物質(zhì)外,部分CYP酶還在藥物等外源性物質(zhì)的代謝方面起到重要作用。通過收集和注釋哺乳動(dòng)物CYP酶的序列發(fā)現(xiàn),家族規(guī)模發(fā)生顯著變化的七個(gè)活躍亞家族均屬于CYPl~4家族.相比之下,非CYPl~4家族的家族規(guī)模則基本保持穩(wěn)定。基于二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)結(jié)果,六段底物識(shí)別位點(diǎn)(substrerecognitionsites,SRSs)的進(jìn)化速率在CYPl~4家族中,特別是活躍的亞家族中,也顯著快于非CYPl~4家族。同時(shí),SRSl~3的進(jìn)化速率顯著快于SRS4~6,說明SRSl.3在更大程度上決定了CYP酶在進(jìn)化過程中所獲得的新功能。

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