結(jié)核分枝桿菌RodA蛋白結(jié)構(gòu)特征的生物信息學(xué)分析
關(guān)鍵詞：結(jié)核分枝桿菌 roda 蛋白結(jié)構(gòu) 抗原性
摘要：運(yùn)用生物信息學(xué)軟件分析及預(yù)測結(jié)核分枝桿菌Rv0017c基因編碼蛋白RodA的結(jié)構(gòu)與功能。采用NCBI、ExPASY、PSORTb等在線工具分析結(jié)核分枝桿菌Rv0017c的基因信息,分析其保守域、理化性質(zhì)和亞細(xì)胞定位;利用SOPMA、Vaxijen v2.0等軟件預(yù)測RodA蛋白的二、三級結(jié)構(gòu)和抗原性。結(jié)果表明:Rv0017c基因全長1 410 bp,編碼469個氨基酸,分子量為50 610.83,蛋白序列具有高度的保守性。RodA的二級結(jié)構(gòu)中,α螺旋所占比例最多,其次是C無規(guī)卷曲結(jié)構(gòu),而β折疊相對占比很少。RodA并非MTB發(fā)揮毒力效應(yīng)的蛋白因子,但具有較高的抗原性。結(jié)論為RodA蛋白序列保守穩(wěn)定,在結(jié)核菌的膜壁形成中發(fā)揮巨大作用,且具有較高的抗原性,可作為治療耐藥結(jié)核的新靶標(biāo)。
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