中國地鼠口腔鱗狀細胞癌相關(guān)的長鏈非編碼RNA差異表達譜建立及應(yīng)用
關(guān)鍵詞：中國地鼠 口腔鱗狀細胞癌 長鏈非編碼rna
摘要：目的 篩選中國地鼠口腔鱗狀細胞癌組織樣本中具有差異表達的長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,LncRNA),預(yù)測其靶基因,探究靶基因的生物學(xué)功能及富集的信號通路。方法 采用二甲基苯并蒽涂抹法建立中國地鼠口腔鱗狀細胞癌模型,高通量測序技術(shù)構(gòu)建LncRNA差異表達譜,生物信息學(xué)技術(shù)篩選差異表達的LncRNA并進行靶基因預(yù)測,GO與KEGG富集分析分別預(yù)測靶基因的生物學(xué)功能及富集的信號通路。結(jié)果 與正常組織樣本相比,口腔鱗狀細胞癌組織樣本中篩選出54個顯著差異表達LncRNA(31個上調(diào),23個下調(diào))。功能性分析表明:與口腔癌相關(guān)的GO條目73條;KEGG富集的信號通路25條。結(jié)論 中國地鼠口腔鱗狀細胞癌樣本中差異表達的LncRNA可能通過靶向調(diào)控其靶基因參與調(diào)控多種生物學(xué)功能及口腔癌相關(guān)的信號通路,在口腔鱗狀細胞癌形成過程中可能發(fā)揮重要作用。
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