雞FGF13基因生物信息學(xué)及組織表達分析
關(guān)鍵詞：雞 成纖維細胞生長因子13 序列分析 結(jié)構(gòu)預(yù)測 表達模式
摘要：研究使用多種生物信息學(xué)分析軟件和多種在線生物信息分析工具,探究雞成纖維細胞生長因子13(FGF13)基因及其編碼蛋白的序列結(jié)構(gòu)及遺傳學(xué)特性,并分析其組織表達情況。結(jié)果顯示:雞FGF13基因編碼區(qū)DNA序列長582 bp,共編碼氨基酸193個;同源性分析發(fā)現(xiàn),雞FGF13基因具有較高的保守性,其核苷酸序列及其編碼的氨基酸序列與鳥類中鴿和火雞的同源性均達95%以上;氨基酸序列分析發(fā)現(xiàn),該蛋白為不穩(wěn)定的水溶性蛋白,分子質(zhì)量為21.65 ku,理論等電點為9.33,無信號肽序列;亞細胞定位主要為細胞核內(nèi),屬于非分泌蛋白;預(yù)測含有30個磷酸化位點,3個糖基化位點,具有FGF結(jié)構(gòu)域;二級結(jié)構(gòu)主要以無規(guī)則卷曲和β折疊為主,三級結(jié)構(gòu)為卷曲狀折疊結(jié)構(gòu);該基因在雞早期生長過程中隨周齡的增大在腿肌中的表達量呈下降模式。研究結(jié)果為FGF13基因功能的進一步分析,以及該基因在雞生長發(fā)育及其他方面調(diào)控作用研究提供了更充分的分子生物學(xué)基礎(chǔ)信息和理論依據(jù)。
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