Oncomine數(shù)據(jù)庫在腫瘤研究中的應用
關鍵詞：oncomine數(shù)據(jù)庫 癌基因 基因表達與分析
摘要：Oncomine是目前世界上最大的癌基因芯片數(shù)據(jù)庫和綜合數(shù)據(jù)挖掘平臺之一,該數(shù)據(jù)庫整合了GEO、TCGA和已發(fā)表文獻來源的RNA和DNA-seq數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)庫目前含有715個基因表達數(shù)據(jù)集(datasheet)、86 733個人體腫瘤組織和正常組織樣本的信息,且有新的數(shù)據(jù)不斷更新。Oncomine數(shù)據(jù)庫囊括的腫瘤類型有19種,包括:膀胱癌、腦/中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤、乳腺癌、宮頸癌、結(jié)直腸癌、食管癌、胃癌、頭/頸腫瘤、腎癌、白血病、肝癌、肺癌、淋巴瘤、黑色素瘤、骨髓瘤、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤。本文就如何利用Oncomine數(shù)據(jù)庫,進行腫瘤組織中癌基因表達差異性分析以及基因共表達分析、癌基因在腫瘤組織中的表達及拷貝數(shù)分析、多組研究數(shù)據(jù)集的薈萃分析(metaanalysis)、以及癌基因表達與患者生存率關系等進行分析。通過該數(shù)據(jù)庫可以對腫瘤癌基因進行研究前的篩查,有利于發(fā)現(xiàn)新的腫瘤生物標記物或治療靶點,為臨床科學研究奠定一定的理論基礎。
中國生物化學與分子生物學報雜志要求:
{1}引言一般不超過300個字，闡明研究目的、研究或觀察依據(jù)、國內(nèi)外研究現(xiàn)狀等。引言部分可引用少量參考文獻，不應進行詳細討論。
{2}本刊在尊重原稿的前提下，對來稿作必要的修改或刪節(jié)。所有文章一經(jīng)發(fā)表，即有權提供給各合法電子媒體使用，作者若不同意，請在投稿時說明。
{3}力求簡明扼要、醒目、突出主題。盡量避免使用縮寫詞。中文文題一般以20個漢字以內(nèi)為宜。中英文標題應一致。
{4}參考文獻：各篇文獻要按正文部分標注的序號依次列出，連續(xù)編碼，并將序號置于方括號中。
{5}作者來稿請附作者簡介：姓名、出生年、性別、民族（漢族可省略）、籍貫、職稱、學位、簡歷及研究方向等。
注：因版權方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
