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樹鼩PSEN1全長編碼序列的克隆及分子特征分析

李明學(xué); 王文廣; 李娜; 匡德宣; 仝品芬; 黃鑫; 黎曉慧; 孫曉梅; 陸彩霞 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院/北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所樹鼩種質(zhì)資源中心; 昆明650118; 昆明醫(yī)科大學(xué); 昆明650500

關(guān)鍵詞:樹鼩 psen1 分子克隆 系統(tǒng)發(fā)育分析 

摘要:目的 獲取樹鼩早老素蛋白-1(PSEN1)的全長編碼序列并進(jìn)行分子特征分析。方法 以樹鼩腦組織總RNA為材料,通過RT-PCR、RACE-PCR擴(kuò)增和序列拼接獲得PSEN1基因全長編碼序列,進(jìn)而通過DNAMAN、MEGA等生物信息學(xué)軟件對其序列和分子特征進(jìn)行分析。qRT-PCR和Western Blot進(jìn)一步分析PSEN1在樹鼩各個組織的表達(dá)模式。結(jié)果 克隆鑒定了樹鼩PSEN1基因,其cDNA的開放閱讀框全長1128 bp,編碼375個氨基酸。通過系統(tǒng)發(fā)育譜系樹、氨基酸序列對比分析,發(fā)現(xiàn)樹鼩PSEN1與小鼠、大鼠等相比更接近人類和非人靈長類動物。qRT-PCR和Western Blot的結(jié)果表明,樹鼩PSEN1在腦組織的表達(dá)量明顯高于其他臟器組織。結(jié)論 通過克隆樹鼩PSEN1基因序列并進(jìn)行分析,為今后進(jìn)一步深入研究該基因功能和建立相關(guān)疾病動物模型提供理論基礎(chǔ)。

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