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巨龍竹肉桂醇脫氫酶基因(DsCAD)的克隆及功能分析

孫金金; 朱金鑫; 王娟; 楊宇明; 西南林業(yè)大學; 云南省林業(yè)科學院國家林業(yè)局云南珍稀瀕特森林植物繁育和保護重點實驗室; 云南省林業(yè)科學院云南省森林培育與開發(fā)利用重點實驗室

關鍵詞:肉桂醇脫氫酶 巨龍竹 基因克隆 熒光定量 

摘要:肉桂醇脫氫酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)是木質素生物合成途徑的關鍵酶。研究根據(jù)巨龍竹轉錄組數(shù)據(jù)設計的一對特異引物,運用逆轉錄PCR(RT-PCR)技術從巨龍竹莖稈中克隆得到肉桂醇脫氫酶基因DsCAD,該基因包含1080 bp的完整c DNA開放閱讀框,編碼359個氨基酸,理論相對分子質量38689.6,等電點6.18。利用生物信息學方法對DsCAD進行分析,結果顯示:DsCAD氨基酸序列包含CAD超家族的保守結構域,具有植物CAD基因的典型特征;其與禾本科植物CAD基因的同源性較高,親緣關系較近,其中與孝順竹的同源性高達95%。熒光定量PCR檢測結果顯示DsCAD基因在巨龍竹竹筍中的表達量要高于莖稈,而在莖稈中的表達量有明顯高于葉。

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